Công ty bắt đầu hoạt động sản xuất dược phẩm từ năm 1979, với tên gọi là Xí nghiệp dược phẩm II Nghĩa Bình. Đến tháng 6 năm 1995 theo quyết định số: 922/QĐ-UB của UBND Tỉnh Bình Định, Công ty Dược - Trang Thiết Bị Y Tế Bình Định được thành lập, trên cơ sở hợp nhất 2 đơn vị nhà nước trực thuộc Sở Y Tế Bình Định, là Xí nghiệp Dược phẩm Bình Định và Công ty Dược phẩm - Dược liệu - Vật tư Y tế Bình Định. Trải quá nhiều thăng trầm trong lịch sử phát triển, công ty đã vượt qua nhiều khó khăn, học hỏi, tự hoàn thiện và đã trở thành một trong những đơn vị hàng đầu trong ngành công nghiệp dược Việt Nam.

Ngày nay, trước những đòi hỏi của thị trường về những sản phẩm chất lượng cao, số lượng lớn để phục vụ cho công tác điều trị bệnh, Bidiphar đã đầu tư phát triển một công nghệ sản xuất hiện đại và tự động hóa hoàn toàn. Tất cả các dây chuyền sản xuất đều khép kín, liên tục, đảm bảo độ vô trùng cao, khả năng chống nhiễm chéo giữa các khu vực sản xuất với môi trường ngoài được thực hiện rất khoa học và nghiêm túc theo tiêu chuẩn GMP.

Sản phẩm của Bidiphar bao gồm các dạng thuốc chữa bệnh: Thuốc bột, thuốc cốm, thuốc nước uống, thuốc kem, thuốc mỡ, thuốc nhỏ mắt, thuốc tiêm dung dịch, thuốc tiêm truyền, thuốc viên nén, viên bao, thuốc viên nang, thuốc tiêm đông khô, bột pha tiêm; nước khoáng, nước giải khát bổ dưỡng và trang thiết bị y tế.